Sebagai limbah dari buah nanas, kulit buah nanas masih mengandung enzim bromelin yang cukup tinggi. Bromelin tergolong kelompok enzim protease sufhidril yang mampu menguraikan struktur molekul protein menjadi asam amino. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan berat molekul enzim bromelin dari kulit buah nanas (Ananas comosus L. Merr) yang berbeda varietas dengan menggunakan metode SDS-PAGE. Isolasi enzim bromelin dari kulit buah nanas menggunakan buffer fosfat 0,1 M pH 7, kemudian disentrifugasi dan dipresipitasi dengan penambahan amonium sulfat 60%. Dialisis enzim menggunakan tabung selofan dengan ukuran pori 12.000 Dalton. Larutan enzim hasil dialisis selanjutnya ditentukan berat molekul dengan metode SDS-PAGE. Hasil analisis berat molekul enzim bromelin varietas Bogor dan Subang tidak berbeda, kedua enzim bromelin yang didapat mempunyai berat molekul berkisar 30,654 kDa.