Simulasi Molecular Docking Dan Molecular Dynamic Senyawa Fenolik Pada Ekstrak Etanol 70% Biji Buah Tomat (Solanum Lycopersicum) Terhadap Enzim Asetilkolinesterase (Ache) Sebagai Anti Alzheimer

ryan aprizal rivaldi;

Alzheimer merupakan penyakit neurodegeneratif yang disebabkan oleh penurunan sintesis asetilkolin akibat pemecahan asetilkolin menjadi kolin dan asetat oleh enzim asetilkolinesterase (AChE). Senyawa dengan aktivitas inhibitor AChE diketahui merupakan kandidat obat yang menjanjikan untuk mengobati penyakit ini. Penelitian ini bertujuan untuk memprediksi senyawa ekstrak etanol 70% pada biji buah tomat yang memiliki potensi paling baik sebagai kandidat obat anti alzheimer terhadap enzim asetilkolinesterase (AChE) dengan obat pembanding Donepezil. Metode penelitian ini menggunakan metode molecular docking dengan software autodock Tools-1.5.6. untuk memprediksi senyawa ekstrak etanol 70% pada biji buah tomat yang mempunyai potensi terbaik sebagai kandidat obat anti alzheimer dilihat dari nilai energi bebas (ΔGBind), cluster, dan Ki serta memprediksi kestabilan dengan metode molecular dynamics menggunakan software GROMACS melalui analisis energi potensial, RMSD, RMSF, Girasi, dan MMPBSA. Hasil penelitian molecular docking menunjukkan senyawa grossamide memiliki nilai energi bebas (ΔGBind) -15.35 kkal/mol dan hasil dari molecular dynamics menunjukkan spermidine, N,N″-bis(3,4-dihydroxycinnamoyl) memiliki energi bebas (ΔGBind) -228.178 kJ/mol tidak lebih baik dari pembandingan senyawa donepezil yang lebih stabil dengan nilai energi bebas (ΔGBind) -349.037 kJ/mol. Grossamide dan spermidine, N,N″-bis(3,4-dihydroxycinnamoyl) dari ekstrak etanol 70% biji tomat berpotensi sebagai inhibitor AChE. Meski energi bebas ikatannya lebih tinggi dari donepezil, keduanya tetap menunjukkan interaksi stabil dan layak dipertimbangkan sebagai kandidat awal obat anti alzheimer alami.