Simulasi Molecular Docking Dan Molecular Dynamic Senyawa Pada Ekstrak Etanol Tanaman Krokot (Portulaca Oleracea) Terhadap Enzim Poly (Adp-Ribose) Polymerase-1 (Parp-1) Sebagai Antikanker Ovarium

dimas awaludin;

Kanker adalah sel yang mempunyai sifat pertumbuhan tidak terkontrol dan mempunyai kemampuan untuk menginvasi ke organ sekitar. Sel kanker ini dapat tumbuh pada saluran organ tubuh manusia, termasuk ovarium. Poly (ADP-ribose) polymerase-1 adalah enzim yang bertugas dalam perbaikan kerusakan DNA sel kanker ovarium, dengan menghambat enzim Poly (ADP-ribose) polymerase-1 maka perbaikan DNA akan terganggu pada sel kanker, sehingga menyebabkan kematian pada sel kanker. Penelitian ini bertujuan untuk memprediksi senyawa ekstrak etanol pada herba krokot yang memiliki potensi paling baik dalam menghambat enzim Poly (ADP-ribose) polymerase-1 sebagai kandidat obat antikanker ovarium dengan pembanding Olaparib. Metode penelitian ini menggunakan metode molecular docking dengan software Autodock untuk memprediksi senyawa ekstrak etanol herba krokot yang mempunyai potensi terbaik sebagai kandidat obat antikanker ovarium dilihat dari nilai energi bebas (ΔGBind), cluster, dan Ki serta memprediksi kestabilan dengan metode molecular dynamics menggunakan software GROMACS melalui analisis energi potensial, RMSD, RMSF, Girasi, dan analisis MMPBSA. Hasil penelitian menunjukan senyawa Stigmasterol memiliki nilai energi bebas (ΔGBind) -11,48 kkal/mol dan hasil molecular dynamics menunjukan Stigmasterol memiliki nilai energi bebas (ΔGBind) -74,519 kJ/mol sementara untuk senyawa Ergosterol memiliki nilai energi bebas (ΔGBind) -11,12 kkal/mol dan nilai energi bebas (ΔGBind) molecular dynamics memiliki nilai -18,563 kJ/mol, kedua senyawa tersebut tidak lebih baik dari pembandingnya senyawa Olaparib yang lebih stabil dengan nilai energi bebas (ΔGBind) -12,01 kkal/mol dan -93,357 kJ/mol nilai energi bebas (ΔGBind) molecular dynamics. Sehingga senyawa Stigmasterol masih berpotensi sebagai kandidat obat baru antikanker ovarium.