Simulasi Docking Dan Molecular Dynamics Senyawa Minyak Atsiri Daun Kemangi (Ocimum Sanctum) Terhadap Enoyl-Acyl Carrier Protein (Acp)-Reductase (Inha) Sebagai Antituberkulosis

ahmad maldini;

Tuberkulosis (TB) adalah penyakit yang disebabkan oleh infeksi bakteri
Mycobacterium tuberkulosis (MTB) yang ditularkan melalui droplet. Daun
Kemangi (Ocimum sanctum) merupakan tumbuhan yang diketahui memiliki
aktivitas menghambat pertumbuhan bakteri MTB. Tujuan penelitian memprediksi
kandidat senyawa minyak atsiri daun kemangi terhadap reseptor target enoyl-acyl
carrier protein (ACP)-reductase (InhA) dengan menggunakan obat pembanding
Isoniazid. Pada penelitian ini menggunakan metode molecular docking dengan
software Autodock untuk senyawa minyak atsiri daun kemangi yang memiliki
potensi terbaik sebagai kandidat antituberkulosis dilihat dari energi binding, kluster,
dan Ki serta menggunakan metode molecular dynamics dengan software
GROMACS untuk menginvestigasi kestabilan melalui energi potensial, RMSD,
RMSF, Girasi, dan MMPBSA. Hasil penelitian Molecular Docking menunjukkan
senyawa α-Cadinol dan Copaene diprediksi memiliki afinitas yang baik dengan
nilai energi bebas -7,83 kkal/mol dan -7,65 kkal/mol serta hasil Molecular
Dynamics menunjukkan α-Cadinol dan Copaene memiliki kestabilan yang baik
dengan nilai energi bebas -116,019 kkal/mol dan -86,497 kkal/mol. Kesimpulan
dari penelitian ini senyawa α-Cadinol dan Copaene dari miny