Simulasi Penambatan Molekuler Dan Dinamika Molekuler Senyawa Ekstrak Rosemari (Rosmarinus Officinalis L. ) Terhadap Erα Sebagai Anti Kanker Payudara

Rahman Sadli Waraiya;

Kanker payudara merupakan penyakit kanker yang paling sering diderita oleh wanita
dan merupakan penyakit kanker dengan jumlah kasus baru terbanyak di dunia pada
tahun 2020. Ekstrak Rosemari diketahui memilki potensi sebagai antikanker payudara
karena menghambat ERα pada sel T-47D dan sel MCF-7 dengan IC50 masing-masing
sebesar 38,3 ± 2,8 μg/mL dan 65,5 ± 8,7 μg /mL. Penelitian ini bertujuan untuk
menguji afinitas dan kestabilan senyawa Rosemari terhadap ERα sebagai antikanker
payudara dengan metode penambatan molekuler dan dinamika molekuler.
Penambatan molekuler dilakukan menggunakan Autodock 4.0 dan dinamika
molekuler menggunakan Gromacs. Hasil penambatan molekuler menunjukan
Kariofilen Oksida memiliki nilai afinitas sebesar -7,70 kkal/mol sedangkan tamoxifen
sebagai kontrol positif sebesar -10,33 kkal/mol. Hasil dinamika molekuler
menunjukan kompleks protein Kariofolen oksida memiliki nilai energi potensial dan
Root Mean Square Distance (RMSD) yang stabil sedangkan nilai Root Mean Square
Fluctuation (RMSF), Radius of Gyration, ikatan hidrogen dan energi energi bebas
(ΔG) dengan metode Molecular Mechanics Poisson–Boltzmann Surface Area
(MMPBSA) menunjukan kompleks protein Kariofilen Oksida tidak lebih stabil
dibandingkan kompleks protein tamoxifen.