MOLECULAR DOCKING DAN MOLECULAR DYNAMIC SENYAWA DAUN GALOBA MERAH (Alpinia zerumbet) TERHADAP RESEPTOR SIKLOOKSIGENASE 2 SEBAGAI ANTIINFLAMASI

dinda permata santi;

Daun Galoba Merah merupakan salah satu tanaman yang berkhasiat sebagai
antiinflamasi. Ekstrak metanol daun Galoba Merah menunjukkan efek
antiinflamasi menghambat COX-2. Penelitian bertujuan untuk mengetahui
kandidat senyawa pada daun Galoba Merah yang memiliki potensi sebagai
antiinflamasi secara molecular docking dan molecular dynamics. Molecular
docking dilakukan dengan menggunakan software Autodock4.2 sedangkan
molecular dynamic menggunakan software GROMACS. Hasil molecular docking
menunjukkan senyawa dengan binding energy terbaik adalah Diosmetin dengan
binding energy -7,53 kkal/mol, Ki 1,41 μM, dan cluster 35 sedangkan senyawa
dengan cluster terbaik adalah Chrysoeriol dengan binding energy 7,53 kcal/mol,
KI 3,01 μM, dan cluster 48. Hasil penelitian molecular dynamic ligan uji
memiliki kestabilan sebanding dengan pembanding selektif Celecoxib
berdasarkan parameter analisis molecular dynamic seperti RMSF, RMSD, jari-jari
girasi, dan energi potensial, sedangkan berdasarkan parameter MM-PBSA,
Celecoxib sebagai pembanding memiliki afinitas yang lebih baik dibandingkan
ligan uji. Kesimpulan dari penelitian ini senyawa pembanding Celecoxib lebih
berpotensi sebagai inhibitor COX-2 jika dibandingkan dengan senyawa uji
Diosmetin dan Chrysoeriol.