Penggunaan Gen 16s Rrna Untuk Identifikasi Bakteri Simbion Karang Lunak Dendronephthya Sp. Penghasil Zat Antibiotik Dari Perairan Pulau Panggang Kepulauan Seribu, Jakarta

dini anugrahati;

Karang lunak Dendronephthya sp. menghasilkan metabolit sekunder yang memiliki aktivitas antibakteri. Produksi metabolit sekunder dipengaruhi oleh mikroba yang berasosiasi dan kondisi lingkungan sekitarnya. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi isolat bakteri yang bersimbiosis dengan karang lunak Dendronephthya sp. penghasil zat antibiotik berdasarkan hasil analisis sekuens gen 16S rRNA. Penelitian ini berhasil mendapatkan empat isolat bakteri yang berasosiasi dengan karang lunak Dedronephthya sp. yaitu, PD8-D1, PD8- D2, PD8-D3, dan PD8-D4. Metabolit sekunder dari isolat bakteri tersebut kemudian diuji aktivitas antibiotiknya menggunakan metode difusi agar. Isolat bakteri PD8-D2 mempunyai potensi antibiotik paling besar, kemudian diisolasi DNAnya dengan menggunakan Wizard Genomic DNA Purification Kit dan diamplifikasi dengan teknik PCR menggunakan primer 27f dan 1492r. Produk PCR kemudian disekuens urutan DNAnya dan disejajarkan dengan data pada Basic Local Alignment Search Tool (BLAST). Hasil penyejajaran sekuens gen 16 rRNA menggunakan sistem BLAST, menunjukkan isolat PD8-D2 memiliki kemiripan 99% dengan Pseudomonas pseudoalcaligenes strain Stanier 63.