Aplikasi Teknik Pcr Untuk Identifikasi Bakteri Simbion Karang Lunak Sarcophyton Sp. Penghasil Antibakteri Dari Perairan Pulau Panggang Kepulauan Seribu, Jakarta

fitri fitriani;

Keberadaan bakteri yang bersimbiosis dengan karang lunak telah memungkinkan
penggunaan mikroorganisme tersebut sebagai senyawa antibakteri. Penelitian ini
bertujuan mendapatkan isolat bakteri simbion dari karang lunak Sarcophyton sp.
dan mengidentifikasi isolat yang didapat secara molekular terhadap gen 16S
rRNA. Metabolit sekunder bakteri simbion karang lunak Sarcophyton sp. diuji
aktivitas antibakterinya terhadap Escherichia coli dan Staphylococcus aureus.
Isolat yang memiliki potensi terbesar diisolasi DNA genom menggunakan Wizard
Genomic DNA Purification Kit dan diamplifikasi dengan menggunakan sepasang
primer 27f dan 1492r. Hasil amplifikasi dibaca urutan basanya melalui proses
sekuensing dan kemudian dilakukan penyejajaran melalui program blastn pada
GenBank. Pada penelitian ini didapatkan tiga isolat bakteri yaitu S1FI, S2FI, dan
S3FI. Isolat S2FI memiliki zona bening terbesar pada aktivitas antibakteri. Isolat
tersebut merupakan koloni berwarna kuning dengan bentuk sel basil dan bersifat
Gram negatif. Berdasarkan urutan nukleotidanya secara filogenetik memiliki
kemiripan dengan Pseudomonas chloritidismutans strain AW-1.