Analisis Sekuensing Gen 16s Rrna Terhadap Bakteri Patogen Penyebab Infeksi Neonatal Di Rumah Sakit Umum Daerah Koja Jakarta Utara

sigit iswahyudi;

Infeksi neonatal merupakan suatu hal terjadinya mikroba yang masuk kedalam tubuh penderita bayi. Bakteri patogen penyebab infeksi neonatal dideteksi menggunakan teknik molekuler. Polymerase Chain Reaction (PCR) dapat digunakan untuk mengamplifikasi sekuen target gen 16S rRNA dari bakteri patogen. Kelima sampel yang didapat dari RSUD Koja Jakarta Utara diekstraksi menggunakan GeneJET Genomic DNA Purification Kit, lalu diamplifikasi dengan penggunaan primer 63f dan 1387r. Hasil amplikon positif dengan adanya pita pada gel elektroforesis di daerah sekitar 1500 bp. Kemudian amplikon disekuensing dan dilakukan data alignment pada menu nucleotide Basic Local Alignment Search Tool (BLAST). Berdasarkan hasil alignment dapat disimpulkan bahwa sampel memiliki kemiripan dengan bakteri Acinetobacter baumannii ATCC 17978 strain ATCC 17978. Bakteri ini merupakan salah satu penyebab terjadinya infeksi neonatal pasien di RSUD Koja Jakarta Utara.