Penggunaan Gen 16s Rrna Pada Identifikasi Molekular Terhadap Bakteri Patogen Diare Dari Rumah Sakit Umum Daerah Koja Jakarta Utara

yayat hariman;

Diare merupakan penyakit yang disebabkan oleh infeksi bakteri. Identifikasi bakteri patogen dapat dilakukan dengan menggunakan teknik molekular. Penelitian ini dilakukan untuk mendeteksi bakteri patogen penyebab diare dengan metode Polymerase Chain Reaction (PCR), menggunakan analisis sekuens gen 16S rRNA. Kelima sampel yang diperoleh dari RSUD Koja Jakarta Utara diisolasi menggunakan GeneJET Genomic DNA Purification kit, kemudian diamplifikasi dengan PCR menggunakan primer 63f dan 1387r. Hasil PCR satu sampel yaitu EC 01 positif ditunjukkan dengan adanya fragmen DNA pada gel elektroforesis dengan ukuran 1300 bp. Hasil ini dilanjutkan dengan sekuensing dan penyejajaran data pada nucleotide Basic Local Alignment Search Tool (BLAST). Berdasarkan hasil analisa sekuens gen 16S rRNA isolat bakteri patogen penyebab diare yang diperoleh dari RSUD Koja Jakarta Utara diidentifikasi sebagai Escherichia coli strain NBRC 102203