Efektivitas Penanda Molekuler Issr (Inter Simple Sequence Repeats) Pada Proses Amplifikasi Dna Empat Spesies Lumut Genus Marchantia

hariyanto dan kurnia heriansyah; dra. hj. maryanti setyaningsih, m.si; susilo, s.pd, m.si;

Olla Anggia. NIM. 1301145077. Efektivitas Penanda Molekuler ISSR (Inter Simple Sequence Repeats) pada Proses Amplifikasi DNA Empat Spesies Lumut Genus Marchantia Skripsi. Jakarta: Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan, Universitas Muhammadiyah Prof. DR. HAMKA, 2017. Tujuan penelitian ini adalah untuk melihat efektivitas lima pasang primer ISSR (JQ812721F dan JQ812721R, JQ812718F dan JQ812718R, JQ812714F dan JQ812714R, JQ307463F dan JQ307463R, JQ307442F dan JQ307442R) pada Marchantia emarginata, Marchantia geminata, Marchantia paleacea, dan Marchantia polymorpha dan untuk mengetahui nilai PIC masing-masing primer. Penelitian dilakukan di Laboratorium Sel dan Molekuler Balai Besar Penelitian Bioteknologi dan Sumberdaya Genetika Pertanian (BB-Biogen) Cimanggu-Bogor. Analisis penanda ISSR dilakukan pada empat spesies. Ekstraksi DNA dilakukan dengan menggunakan prosedur berbasis CTAB (Cetyl Trimethylammonium Bromide). Selanjutnya, DNA diamplifikasi dengan teknik PCR (Polymerase Chain Reaction) menggunakan lima pasang primer ISSR (Inter Simple Sequence Repeats). Hasil penelitian menunjukkan tiga pasang primer ISSR (JQ812721F dan JQ812721R, JQ812718F dan JQ812718R, JQ812714F dan JQ812714R) yang diuji dapat teramplifikasi dan bersifat polimorfis pada empat spesies Marchantia. Nilai PIC tertinggi terdapat pada pasangan primer JQ812714F dan JQ812714R sebesar 0,91. Nilai PIC pada pasangan primer JQ812721F dan JQ812721R 0,90 dan pasangan primer JQ812718F dan JQ812718R memiliki nilai primer paling rendah dengan nilai 0,64. Berdasarkan hasil penelitian terdapat tiga pasang primer yang dapat mengamplifikasi DNA empat spesies Marchantia dengan nilai PIC yang sangat informatif.