Karakterisasi Dna Pakis Simpei (Cibotium barometz) Hasil Subkultur Dengan Metode Rapd

amelia zainita, se., mm; dr. hj. susanti murwitaningsih, m.pd; susilo, s.pd., m.si;

Dara Iqrimah Nur’islamiah Ramadhan. Karakterisasi DNA Pakis Simpei (Cibotium barometz) Hasil Subkultur Dengan Metode RAPD. Skripsi. Jakarta: Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan, Universitas Muhammadiyah Prof. DR. HAMKA, 2017. Pakis Simpei (Cibotium Barometz) merupakan jenis tumbuhan paku memiliki karakter morfologi yang unik dan mempunyai nilai ekonomis karena memiliki banyak manfaat. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui karakter DNA Pakis Simpei hasil subkultur setelah diberi perlakuan nitrogen dengan metode RAPD. Penelitian ini dilakukan di Laboratorium Biologi Molekuler, Balai Besar Penelitian Bioteknologi dan Sumberdaya Genetik Pertanian (BB-Biogen) pada bulan Juli sampai November 2017. Penelitian ini menggunakan 3 sampel pakis simpei (CB1, CB2, dan CB3) dan I sampel induk (CB0 sebagai control). Sampel hasil subkultur pakis simpei diperoleh dari Laboratorium Kultur Jaringan Pusat Konservasi Tumbuhan LIPI, Kebun Raya Bogor. Keempat sampel digunakan untuk analisis genetik dengan menggunakan metode RAPD. Data molekuler hasil RAPD berupa pita DNA yang selanjutnya diubah menjadi data kuantitatif dengan melakukan skoring menjadi data biner. Hasil skoring dianalisis mengguanakan aplikasi NTSYS Ver. 2.1 untuk mengetahui perbedaan dan jarak genetik antar sampel. Hasil penelitian menunjukkan bahwa 3 sampel pakis simpei yang telah diberi perlakuan nitrogen terdapat variasi DNA yang berbeda satu dengan yang lainnya. Berdasarkan hasil analisis GelAnalyzer menunjukan sifat polimorpis dimiliki oleh primer OPT01, OPT02, OPT04, dan OPT05. Sedangkan sifat monomirpis hanya dimiliki oleh primer OPT03. Penelitian ini dapat dilihat dari hasil dendogram kekerabatan terdekat dari 3 sampel bahwa terbagi menjadi tiga kelompok. Sampel CB0 lebih dekat kekerabatannya dengan CB2 dengan kesamaan 65%, dan CB3 memiliki kesamaan 55%, Sedangkan kekerabatan terjauh dari sampel yang lainnya yaitu CB1 dengan kesamaan 49%.